Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms