Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF1P22415 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF1P22415 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF1P22415 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF1P22415 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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