Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB1P20618 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms