Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM27P14373 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM27P14373 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms