Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2F2P13984 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms