Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms