Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PYGBP11216 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PYGBP11216 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PYGBP11216 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PYGBP11216 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PYGBP11216 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PYGBP11216 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PYGBP11216 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYGBP11216 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYGBP11216 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYGBP11216 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms