Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI2P10070 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI2P10070 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI2P10070 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GLI2P10070 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI2P10070 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GLI2P10070 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GLI2P10070 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GLI2P10070 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GLI2P10070 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI2P10070 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI2P10070 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI2P10070 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI2P10070 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI2P10070 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI2P10070 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI2P10070 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms