Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB7P09629 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB7P09629 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms