Protein–RNA interactions for Protein: P05060

CHGB, Secretogranin-1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGBP05060 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGBP05060 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGBP05060 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGBP05060 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGBP05060 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHGBP05060 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHGBP05060 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHGBP05060 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHGBP05060 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms