Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD74P04233 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD74P04233 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD74P04233 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD74P04233 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD74P04233 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD74P04233 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD74P04233 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD74P04233 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD74P04233 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms