Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC1P02654 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms