Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DENRO43583 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DENRO43583 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DENRO43583 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DENRO43583 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DENRO43583 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms