Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF316A6NFI3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms