Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms