Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NRXN3Q9Y4C0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRXN3Q9Y4C0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms