Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF346Q9UL40 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF346Q9UL40 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF346Q9UL40 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF346Q9UL40 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF346Q9UL40 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF346Q9UL40 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF346Q9UL40 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms