Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF639Q9UID6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms