Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KCMF1Q9P0J7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms