Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKIRAS2Q9NYR9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms