Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MED17Q9NVC6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms