Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms