Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LHX9Q9NQ69 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms