Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NICN1Q9BSH3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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