Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS8Q99627 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms