Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NMNAT3Q96T66 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMNAT3Q96T66 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms