Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNPRQ8TBG9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms