Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms