Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMARCD3Q6STE5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms