Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6P435 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6P435 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms