Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RWDD4Q6NW29 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RWDD4Q6NW29 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms