Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CC2D1BQ5T0F9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CC2D1BQ5T0F9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms