Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WASHC2DQ5SRD0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms