Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms