Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf46Q504U0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms