Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms