Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NRF1Q16656 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms