Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF239Q16600 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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