Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1EQ15878 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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