Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SS18Q15532 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SS18Q15532 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SS18Q15532 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms