Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms