Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBE4AQ14139 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE4AQ14139 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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UBE4AQ14139 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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UBE4AQ14139 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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UBE4AQ14139 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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UBE4AQ14139 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE4AQ14139 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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