Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB3BPQ13352 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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