Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATMQ13315 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATMQ13315 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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