Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RPA4Q13156 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RPA4Q13156 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPA4Q13156 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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