Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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TRAF3Q13114 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF3Q13114 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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