Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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