Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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FOXF1Q12946 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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