Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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