Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL16A1Q07092 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL16A1Q07092 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms